Penting untuk membezakan akut dari cirit-birit kronik, melokalisasi masalah pada usus kecil atau besar dan memahami apakah cirit-birit itu disebabkan oleh penyakit gastrointestinal primer atau jika ia adalah akibat penyakit ekstraintestinal.
Mengingat pelbagai penyebab cirit-birit dan sifatnya yang berpotensi membatasi diri, pendekatan diagnostik harus berbeza mengikut sejarah klinikal pesakit, keparahan gejala dan ketersediaan pemiliknya.
adalah penyebab yang paling biasa. Dalam kes-kes ini, anamnesis sangat penting (bersentuhan dengan haiwan yang sakit, intoleransi yang diketahui, tinggal di kandang, penggunaan makanan yang tidak dimasak atau dimanjakan). Kehadiran lendir, darah hidup, kesukaran dan mendesak membuang air besar menunjukkan adanya masalah usus besar. , sementara penurunan berat badan dan darah yang dicerna menunjukkan penglibatan usus kecil.
Bagi haiwan yang mengalami cirit-birit ringan, makanan biasa dan penggunaan air, tanpa muntah atau dehidrasi, rawatan sokongan sering kali mencukupi. Sekiranya berlaku tanda-tanda klinikal, dengan kekeringan dan kehilangan selera makan, ujian diagnostik tambahan seperti ujian najis, ujian penyakit berjangkit dan ujian darah diperlukan, dengan perhatian khusus kepada haiwan yang mempunyai tanda-tanda penyakit sistemik.
Cirit-birit pada haiwan pendamping berkaitan dengan Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella dan E. coli. Namun, di sisi lain, banyak haiwan yang sihat menyimpan bakteria ini, dan penemuannya tidak semestinya menunjukkan adanya tanda-tanda klinikal.
Secara khusus, terdapat hubungan yang jelas antara C. perfringens dan cirit-birit hemoragik akut, tetapi tidak jelas sama ada kehadiran bakteria ini adalah penyebab atau akibatnya, disebabkan oleh "perubahan mikroflora usus; yang sama berlaku untuk C. sukar.
Campylobacter, sebaliknya, boleh menyebabkan gejala gastrointestinal terutama pada haiwan muda yang terdedah kepada faktor-faktor predisposisi seperti tekanan, kesesakan dan penyakit bersamaan.
Beberapa jenis E coli boleh menyebabkan jangkitan usus pada anjing dengan sistem kekebalan tubuh yang terganggu, dan sering terlibat dalam kolitis granulomatous Boxer, dengan lesi serupa juga dijelaskan dalam French Bulldog and Border collie.